Điểm khác biệt lớn giữa nhập quốc tịch và giấy phép vĩnh trú là nhập quốc tịch có nghĩa là lấy quốc tịch Nhật.
Người mang quốc tịch nước ngoài khi muốn lấy quốc tịch Nhật thì việc làm thủ tục xin lấy quốc tịch Nhật là điều cần thiết. Mặt khác, Nhật không chấp nhận việc mang hai quốc tịch nên người xin lấy quốc tịch Nhật cần phải chính thức từ bỏ quốc tịch của người đó. Do đó, bạn chưa nhận được sự cho phép của Bộ trưởng Tư pháp thì dù cho có kết hôn với người Nhật, hoặc là trở thành con nuôi của người Nhật, cũng không đổi sang quốc tịch Nhật được một cách tự động.
Đơn xin phép nhập quốc tịch được tiến hành ở các cục tư pháp địa phương. Nếu được cho phép thì tư cách lưu trú sẽ mất đi, thay vào đó sẽ vào quốc tịch Nhật, có được các quyền lợi như bầu cử, đăng ký công dân. Thêm nữa, với tư cách là người Nhật thì gánh lấy các nghĩa vụ về nộp thuế và lao động v.v....Để biết thêm chi tiết xin hãy liên lạc tại các Cục tư pháp địa phương. Lệ phí: tổn tiền