印章登记是市区町村的固有业务，其办理规程依据各市区町村的印章条例的规定。市区町村的通常办理规程如下表所示。可办理印章登记的条件为已经办理好外国人登记且满15周岁以上者。申请办理请到市区町村役所（政府）。可登记的印章一人仅限一个。在印章登记手续办理完之后，即可领取印章登记证。在汽车登记、房产登记、资金借贷等时，需使用替代签字的实印及印章登记证，因此必须十分注意保管印章和印章登记证。
※印章登记证遗失时，必须在提交遗失申报的同时，重新办理新印章登记手续。
※对于通过代理人申请的情形，由于需要委托书而办理手续需几天时间。

　　印章登记有一定限制，以下所示的印章不可进行登记。

　　印章证明书是指可以证明实印（正式印章）为真实印章的证明书。在日本购买土地、住宅、汽车等需签署重要合同时，需要使用实印或印章证明书。印章证明书可通过本人或代理人到役所（政府）的服务窗口提交申请后取得。对于代理人的情形，也不需要委托书。此外，仅凭登记过的印章是不可以取得印章证明书，这点请多加注意。
※在有些役所（政府）设有自动交付机。